В начале второго десятилетия ХХI в. Мемориальный музей истории политических репрессий находился на максимальном подъеме и должен был перейти в новое качество.

В 2011 году Правительство Пермского края перевело психоневрологический интернат, который до этого времени занимал здание казарм охраны лагеря и помещения ряда подсобных лагерных служб, в другое место, передав освободившиеся помещения Мемориальному центру «Пермь-36». В том же году была разработана проектно-сметная документация на их реконструкцию для музейных нужд и начаты первые работы по реконструкции. Общий размер помещений музея увеличился с 4 855 м. кв. до 8 217 м. кв.

Совместно с Правительством края Мемориальный центр начал разработку Генеральной программы развития музея.

В 2011 году губернатор Пермского края Олег Чиркунов по инициативе музея обсудил с руководством одной из известнейших в мире студий музейного дизайна Ralph Appelbaum Associates Incorporated (RAA) возможность разработки и создания с участием RAA генеральной экспозиции музея «Пермь-36» и назначил на июнь 2012 г. обсуждение концепции проекта и подписание контракта с RAA на музеефикацию бывшего политлагеря Пермь-36.

В декабре 2011 года президент РФ Дмитрий Медведев подписал распоряжение «Об образовании при президентском Совете по правам человека и развитию гражданского общества Рабочей группы по подготовке предложений, направленных на реализацию программы увековечения памяти жертв политических репрессий. Первый же вариант разработанной Рабочей группой Концепции Федеральной целевой программы «Об увековечении памяти жертв политических репрессий» рассматривал Мемориальный музей «Пермь-36» как один из трех Мемориально-музейных комплексов памяти жертв политических репрессий национального значения.

В 2012 году рабочая группа утвердила разработанную АНО «Мемориальный центр истории политических репрессий «Пермь-36» концепцию развития Мемориально-музейного комплекса «Пермь-36».