В 1999 году Мемориальный музей истории политических репрессий «Пермь-36» совместно с Тенемент-музеем Нижнего Манхэттена, британским Музеем-работным домом, чешским Музеем гетто Терезин, Музеем-домом рабов Сенегала, южно-африканским музеем Шестого района Кейптауна, музеем Освободительной войны Бангладеш и аргентинским музейным проектом памяти жертв хунты учредили Международную коалицию музеев совести.

В настоящее время в коалицию входит более 300 музеев из 65 стран мира. Все эти музеи связаны, как правило, с местами национальных гуманитарных катастроф, но некоторые, как, например, дом-музей М.Л. Кинга и музей-усадьба Э. и Ф.Д. Рузвельтов – с мощными гуманитарными прорывами.

Мемориальный центр истории политических репрессий «Пермь-36» был создателем и руководителем Российской сети Международной коалиции музеев совести, оказывал музеям сети юридическую и методическую помощь, на протяжении 7 лет организовывал для их сотрудников тренинги в Летней школе музеологии, через директорат Коалиции находил финансовую поддержку и партнеров.