Мемориальный музей истории политических репрессий «Пермь-36» в начале 2012 года находился на вершине своего развития и в ближайшие годы должен был перейти в новое качество – стать мемориально-музейным комплексом федерального значения с широкой международной известностью.

Тогда же администрация Президента РФ взяла курс на искоренение тех немногих демократических институтов, которые к тому времени закрепились в стране, на борьбу с только-только нарождавшимся гражданским обществом, подавление значимых гражданских инициатив. Одной из первых жертв этой борьбы стал Мемориальный музей истории политических репрессий «Пермь-36».

Вскоре после замены в 2012 году избранного губернатора Пермского края новым, назначенным Кремлем, новые власти края зарегистрировали государственное учреждение культуры «Мемориальный комплекс политических репрессий», которому передали в 2014 году здания и сооружения бывшего лагеря Пермь-36. Сотрудники госучреждения с подачи нового руководства Министерства культуры Пермского края захватили все имущество отстраненной от музея Автономной некоммерческой организации «Мемориальный центр истории политических репрессий «Пермь-36», находившиеся на территории музея музейные фонды, архивы, библиотеку, экспозиции и выставки. Новыми консультантами государственного учреждения стали бывшие офицеры лагерей.

Фактическая ликвидация музея истории политических репрессий вызвала шквал публикаций в отечественной и зарубежной прессе, обращения системных правозащитников непосредственно к Президенту РФ Владимиру Путину. В результате властями были инициированы несколько раундов переговоров с Правлением АНО «Пермь-36», но никаких результатов, кроме имитации деятельности, они не принесли.